Från Stockholms blodbad över Sturemorden och nära nog fram till Linköpings blodbad sträcker sig Per Brahes levnadsbana 1520 – 90. Systerson till Gustav Vasa och son till Joachim Brahe som avrättades i Stockholm. Mamman Margareta Eriksdotter gifte om sig med Johan av Hoya, som var nära lierad med Gustav Vasa och hans högra hand i affärerna med Lübeck.
I giftermålet med Margareta 1525 fick den tyske greven Johan av Hoya Nyslott och Viborg i förläning, en besvikelse för han hade väntat sig det centrala och viktiga Kalmar. Per växte upp i Viborg, men familjen såg inte mycket av sitt överhuvud som hela tiden befann sig på resor i kungens uppdrag. 1528 iklädde sig Johan en personlig garanti för att Sverige skulle återbetala sina skulder till Lübeck under perioden 1529 – 32. Lübeck kom under ny förvaltning och förhållandet till Sverige försämrades. Samtidigt lyckades Johan göra sig impopulär för att han inte deltog i rådets möten. Konflikten kom till sin spets 1534 då Sverige vägrade betala den sista raten. Johan valde då officiellt att stå för sitt åtagande och infinna sig som pant i Lübeck, fast han i praktiken flydde från Sverige. Han dog något år senare i fält mot Sverige.
Den tonårige Per hade skickats till Hoya. Några år senare efter moderns död skickade Gustav Vasa efter honom och så inleddes en lysande karriär som morbroderns handgångna man, medlem i rådet, sedermera dubbad till greve 1562 av Erik XIV och utnämnd till Riksdrots av Johan III. Eriks tre grevar och elva baroner var de första sådana utnämningar i Sverige.
Per Brahe var inte militärt aktiv i fält, förutom en misslyckad belägring av Bohus fästning 1563under det svensk/danska sjuårskriget. Tidigare under Dackefejden hade han varit ansvarig för de tyska legoknektarnas försörjning, ett stort stabsjobb i den mån man nu kan tala om separata stabsuppgifter på femtonhundratalet. Under hela sitt liv stod han till sina tre Vasa konungars förfogande och utnyttjades för ett mångfald både interna och externa uppgifter.
Per Brahe gifte sig 1549 med Beata Stenbock. De hade 13 barn av vilka tre dog som spädbarn och den äldsta sonen Joachim som sjuttonåring av ett vådaskott. Förutom sin övriga verksamhet gav Per Brahe sig också tid att skriva tre böcker. Oeconomica är en samling råd till unga adelsmän. Krönikan är ett sammandrag av Gustav Vasas kungagärning och slutligen Trösteboken är en samling citat och filosofiska funderingar.